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麻省理工学院研究人员使用AI发现的抗生素

halicin,是麻省理工学院研究人员使用AI系统发现一种超强抗生素。这项突破性的研究成果于2020年2月20日发表在国际顶尖学术期刊《细胞》杂志上,并登上了当期杂志封面。 halicin是首个由人工智能发现的抗生素 。

研究人员为致敬经典科幻片《2001太空漫游》,将该分子命名为“halicin”(电影里的人工智能系统名为HAL 9000)。

基本信息

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外文名:halicin

特点:首个由人工智能发现的抗生素

研究简史

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麻省理工学院(MIT)的研究人员通过他们的人工智能程序运行了大约6000个分子,寻找可以杀死大肠杆菌的分子。 在所有这些中,AI挑选出了一种对细菌最有效的抗生素化合物。

麻省理工学院的团队在实验室中测试了这种新型化合物时,其效果非常出色,可以杀死了数十种细菌,包括已证明对所有已知抗生素具有抗性的菌株。到目前为止,该化合物的效果令人印象深刻,并且与大多数抗生素的作用不同。

在成功搜寻halicin之后,研究人员正在研究另外8种被AI鉴定为有希望的分子。

名称由来

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该新型抗生素化合物以电影《2001:太空漫游》中的AI命名为“halicin”。

动物试验

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研究人员对从病人身上分离出来的几十种菌株进行了测试。通过实验室培养皿中的培养,研究人员发现该潜在药物能够杀死许多对治疗产生抗药性的细菌,包括艰难梭菌、鲍曼不动杆菌和结核分枝杆菌。除了一种铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa) 外,这种潜在药物对所测试的所有耐药细菌都表现出了显著效果。

为了在活体动物身上测试 halicin 的有效性,研究人员用它来治疗感染了鲍曼尼氏杆菌的老鼠,这种细菌此前已经感染了许多驻扎在伊拉克和阿富汗的美军士兵,而且鲍曼尼氏杆菌对所有已知的抗生素都有耐药性,但使用halicin的治疗后,细菌感染在 24 小时内完全消失。

科学家认为,病原体发展为抗生素耐药性的可能性将大大降低。

学科评价

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卡内基梅隆大学计算生物学家鲍勃·墨菲说:“使用计算方法发现和预测潜在药物特性这一领域方兴未艾,最新研究是一个绝佳实例。”

最新研究联合负责人、MIT计算机科学与人工智能实验室电气工程与计算机科学教授雷吉娜·巴兹莱说:“机器学习模型可以在计算机上探索大型化学空间,而传统实验室方法要做到这一点会非常昂贵。”最新研究既提高了化合物鉴定的准确性,又降低了筛选工作的成本。

以色列理工学院生物学和计算机科学教授罗伊·基肖尼表示:“这项开创性研究标志着抗生素发现乃至更普遍的药物发现发生了范式转变,深度学习技术或可应用于抗生素开发的所有阶段——从发现抗生素到通过药物修饰和药物化学改善抗生素的功效和毒性。”

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