巴黎文理研究大学：巴黎第九大学、巴黎高等师范学校、巴黎高等矿业学校等2010年合并成立，其成员主要是巴黎地区各自独立的大学校（grande école）而非巴黎大学的13所分校。

斯特拉斯堡大学：由斯特拉斯堡一大、斯特拉斯堡二大和斯特拉斯堡三大这三所大学于2009年合并。此前的一大主要发展自然科学，二大主要发展人文学科，三大主要发展法律，政治，社会和技术。斯特拉斯堡大学为欧洲研究型大学联盟成员。斯特拉斯堡市为法国第7大城市，位于法国东部和德国边界，是欧洲议会所在地。

波尔多大学：2014年合并自波尔多第一大学、波尔多第二大学和波多尔第四大学，现为综合性学府。波尔多为法国第9大城市，位于法国西南海岸。

第二批

2012年2月3日法国总理菲永在波尔多宣布了“卓越大学计划”（IDEX）第二批受资助的高等院校名单。其中巴黎地区有三所：

巴黎萨克雷大学：萨科齐总统推动下，2014年12月29日在法国巴黎南郊萨克雷（Saclay）组建，包括巴黎第十一大学（巴黎南大学）、卡尚高等师范学校、巴黎高等商业学校等20余所院校及研究机构。2017年10月25日，法国总统马克龙访问巴黎南郊萨克雷，正式将原有的巴黎萨克雷大学一分为二。

索邦巴黎西岱大学：2014年12月31日合并，包括巴黎第三大学、巴黎第五大学、巴黎第七大学、巴黎第十三大学及巴黎政治学院。在2019年，索邦巴黎西岱大学解散，其位置随后由新成立的巴黎大学取代。

索邦大学：包括巴黎第二大学、巴黎第四大学、巴黎第六大学，2018年1月合并。

其他地区有两所，分别为：

马赛大学：位于法国第1大港口，全国第2大城市马赛，包括马赛一大、马赛二大、马赛第三大学，2012年1月1日合并。

图卢兹大学：位于法国西南与西班牙交界处法国第4大城市图卢兹，包括图卢兹第一大学、图卢兹第二大学、图卢兹第三大学及一所工程师学院，2014年10月更名为图卢兹南部比利牛斯联合大学。这五所当选院校将在4年内共享总额55亿欧元的资助金。

后续

里昂大学：2017年2月27日入选法国 “卓越大学计划”（IDEX），位于法国第3大城市、靠近瑞士和意大利的里昂，包括里昂第一大学、里昂第二大学、里昂第三大学、圣埃蒂安大学、里昂高等师范学校、里昂国立应用科学学院、里昂中央理工学院等11所公立院校、大学校和1所科研机构－法国国家科研中心（里昂）。

格勒诺布尔大学：由格勒地区的三所大学合并而成，其中格勒诺布尔一大着重医学，格勒诺布尔二大原为经济与法律学院，格勒诺布尔三大原为文学院。三所学校于2016年1月1日合并成立新的格勒诺布尔-阿尔卑斯大学。格勒诺布尔为法国16大城市，与里昂较近。

蔚蓝海岸大学（Université Côte d'Azur）：位于靠近摩纳哥的法国第5大城市尼斯，是法国普罗旺斯-阿尔卑斯-蓝色海岸大区的一个大学与院校共同体（ComUE），成员主要包括原尼斯大学。2020年1月1日，学校类型转为实验性机构。

巴黎第十二大学（巴黎东大学）

塞吉-蓬图瓦兹大学（1991年从巴黎第十大学中独立），后组CY塞尔吉-巴黎大学（CY Cergy Paris Université）

外省

南特大学：位于法国西海岸、第6大城市南特。

蒙彼利埃大学：位于法国南部地中海沿岸、第8大城市蒙彼利埃。

里尔大学：位于法国北部、第10大城市里尔，靠近比利时。

勃艮第-弗朗什孔泰大学：位于法国东部、第18大城市第戎，靠近瑞士。

克莱蒙奥弗涅大学：位于法国西南内陆、第21大城市克莱蒙费朗，靠近里昂、格勒诺布尔。

洛林大学：位于法国和德国边界，靠近斯特拉斯堡。

波城大学：位于法国和西班牙交界处波城。