共同利用共同研究基地（Joint Usage/Research Center），是日本政府在全国设立并选拔的一系列顶尖国立、公立和私立大学附属研究所、研究中心的总称。超越了所属单一大学的界限，这些研究机构的设备、资料、数据等可以与日本全国的研究者共享、共同利用。与此同时，他们直接受到日本政府的大力科研经费支撑。平成20年7月，文部科学省统筹了日本全国的顶尖国公私立大学，正式启动了此项目，以推进全国的学术研究和科研创新。截止2014年，日本全国共设置了95个共同利用共同研究基地，他们分别由附属于全国的29所国立大学和17所公私立大学的上百所知名科研机构组成，且个别共同利用共同研究基地由多所研究机构共同组成。

中文名：共同利用共同研究基地

外文名：英文：Joint Usage/Research Center

所属国家：日本

目前基地个数：95个

主要学校：东京大学，京都大学，大阪大学，名古屋大学等

北海道大学遗传病控制研究所

北海道大学触媒化学研究中心

北海道大学Slavic-Eurasian研究中心

北海道大学人体动物感染病研究中心

北海道大学情报基础中心

北海道大学电子科学研究所

带宏畜产大学寄生虫病研究中心

东北大学金属材料研究所

东北大学电气通信研究所

东北大学流体科学研究所

东北大学加龄医学研究所

东北大学电子光理学研究中心

东北大学网络科学中心

东北大学多元物质科学研究所

筑波大学计算科学研究中心

筑波大学基因实验中心

筑波大学下田临海实验中心

群马大学生体调节研究所

千叶大学环境影响因子研究中心

东京大学地震研究所

东京大学地震研究所

东京大学宇宙线研究所

东京大学物性研究所

东京大学大气海洋研究所

东京大学医科学研究所

东京大学史料编纂所

东京大学东洋文化研究所附属东洋学研究情报中心

东京大学社会科学研究所附属社会调查调研研究中心

东京大学粒子物理国际研究中心

东京大学空间情报科学研究中心

东京大学情报基础中心

东京大学海洋基础生物学研究推进中心

东京医科齿科大学疑难病研究所

东京外国语大学亚非语言文化研究所

东京工业大学应用陶瓷材料研究所

东京工业大学学术国际情报中心

东京工业大学资源化学研究所

一桥大学经济研究所

新泻大学脑研究所

富山大学和汉医药学综合研究所

金泽大学癌症发展控制研究所

名古屋大学太阳地球环境研究所

名古屋大学太阳地球环境研究所

（现名古屋大学宇宙地球环境研究所）

名古屋大学地球水循环研究中心

名古屋大学情报基础中心

京都大学生存圏研究所

京都大学防灾研究所

京都大学基础物理学研究所

京都大学数理解析研究所

京都大学核反应堆实验所

京都大学灵长类研究所

京都大学再生医科学研究所

京都大学化学研究所

京都大学病毒研究所

京都大学人文科学研究所

京都大学经济研究所

京都大学东南亚研究所

京都大学生态学研究中心

京都大学放射线生物研究中心

京都大学地域研究统合情报中心

京都大学能量理工学研究所

京都大学野生动物研究中心

京都大学学术情报媒体中心

大阪大学接合科学研究所

大阪大学蛋白质研究所

大阪大学微生物病研究所

大阪大学社会经济研究所

大阪大学核物理研究中心

大阪大学激光能量学研究中心

大阪大学网络媒体中心

大阪大学产业科学研究所

鸟取大学干燥地研究中心

冈山大学资源植物科学研究所

冈山大学地球物质科学研究中心

广岛大学核爆放射线医科学研究所

广岛大学放射光科学研究中心

德岛大学疾患酵素学研究中心

爱媛大学地球深层机理研究中心

高知大学海洋中心综合研究中心

九州大学应用力学研究所

九州大学生体防御医学研究所

九州大学工程数学研究所

九州大学情报基础研究开发中心

九州大学高端物质化学研究所

佐贺大学海洋能研究中心

长崎大学热带医学研究所

熊本大学发生医学研究所

琉球大学热帯生物圈研究中心

和歌山县立医科大学未来医疗推进中心

早稻田大学伊斯兰地域研究机构

早稻田大学坪内博士纪念演剧博物馆